Lệ phí môn bài chấm dứt từ 01/01/2026: doanh nghiệp còn phải khai và nộp gì

Cập nhật theo Nghị quyết 198/2025/QH15, Nghị định 362/2025/NĐ-CP và Công văn 645/CT-CS ngày 23/01/2026

Mỗi tháng 1 hằng năm, việc đầu tiên của kế toán là rà lại tờ khai lệ phí môn bài cho trụ sở chính, cho từng chi nhánh và từng địa điểm kinh doanh. Kể từ năm 2026, công việc quen thuộc đó không còn nữa. Lệ phí môn bài đã chấm dứt thu và nộp, và hai nghị định làm nền cho khoản thu này cũng đã bị bãi bỏ. Bài viết dưới đây trình bày căn cứ của việc chấm dứt, phần nghĩa vụ nào vẫn còn treo lại, và những việc doanh nghiệp cần xử lý cho gọn sổ sách.

Căn cứ chấm dứt thu, nộp lệ phí môn bài

Tại khoản 7 Điều 10 Nghị quyết 198/2025/QH15 về cơ chế, chính sách đặc biệt phát triển kinh tế tư nhân, Quốc hội quy định: “Chấm dứt việc thu, nộp lệ phí môn bài từ ngày 01 tháng 01 năm 2026”. Nghị quyết này có hiệu lực từ ngày 17/5/2025, nhưng riêng nội dung về lệ phí môn bài được ấn định mốc áp dụng là ngày 01/01/2026.

Tiếp đó, tại khoản 4 Điều 6 Nghị định 362/2025/NĐ-CP ngày 31/12/2025 quy định chi tiết một số điều và biện pháp tổ chức, hướng dẫn thi hành Luật Phí và lệ phí, Chính phủ bãi bỏ Nghị định 139/2016/NĐ-CP quy định về lệ phí môn bài và Nghị định 22/2020/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung Nghị định 139/2016/NĐ-CP. Nghị định 362/2025/NĐ-CP có hiệu lực từ ngày 01/01/2026.

Như vậy, khoản thu không chỉ dừng lại trên thực tế mà toàn bộ cơ sở pháp lý của nó cũng đã được gỡ bỏ. Đây là điểm khác biệt cần lưu ý so với các trường hợp miễn, giảm có thời hạn mà kế toán từng gặp: miễn giảm thì nghĩa vụ kê khai vẫn còn, còn ở đây thì cả nghĩa vụ kê khai lẫn nghĩa vụ nộp tiền đều không còn.

Doanh nghiệp không phải nộp tờ khai lệ phí môn bài từ năm 2026

Ngày 23/01/2026, Cục Thuế ban hành Công văn 645/CT-CS gửi Thuế các tỉnh, thành phố để hướng dẫn thống nhất. Căn cứ hai văn bản nêu trên, Cục Thuế xác định kể từ ngày 01/01/2026, người nộp thuế không phải nộp lệ phí môn bài đối với năm 2026 và các năm tiếp theo, đồng thời không phải nộp hồ sơ khai lệ phí môn bài đối với năm 2026 và các năm tiếp theo.

Hướng dẫn này áp dụng cho mọi người nộp thuế, không phân biệt tổ chức hay hộ kinh doanh, không phân biệt trụ sở chính hay chi nhánh, văn phòng đại diện, địa điểm kinh doanh. Doanh nghiệp thành lập mới trong năm 2026 cũng không phát sinh tờ khai lệ phí môn bài, nên mốc “chậm nhất là ngày 30 tháng 01” và mốc khai trong năm đầu thành lập đều không còn phải theo dõi.

Nghĩa vụ của năm 2025 trở về trước vẫn phải nộp đủ

Đây là phần dễ bị bỏ sót nhất. Việc chấm dứt chỉ có hiệu lực về sau, không xoá các khoản đã phát sinh. Tại Công văn 645/CT-CS, Cục Thuế yêu cầu Thuế các tỉnh, thành phố rà soát và áp dụng các biện pháp quản lý thuế theo quy định để thu đúng, thu đủ số tiền lệ phí môn bài phát sinh phải nộp đối với năm 2025 trở về trước vào ngân sách nhà nước.

Cơ quan thuế vì vậy vẫn tiếp tục truy thu phần còn nợ của các năm cũ, kèm tiền chậm nộp nếu có. Doanh nghiệp nên đối chiếu nghĩa vụ thuế trên ứng dụng thuế điện tử để chắc chắn số dư khoản lệ phí môn bài đã về không, đặc biệt là các chi nhánh và địa điểm kinh doanh mở giữa năm, vốn hay bị bỏ quên vì số tiền nhỏ.

Xử lý trên sổ sách kế toán

Từ năm 2026 không còn bút toán trích và nộp lệ phí môn bài, nên phần chi phí quản lý doanh nghiệp của tháng 1 sẽ giảm đúng bằng khoản này so với các năm trước. Khi lập kế hoạch chi phí đầu năm hoặc so sánh cùng kỳ, cần nhớ nguyên nhân chênh lệch để khỏi mất công giải trình.

Với khoản còn nợ của năm 2025 trở về trước, nếu doanh nghiệp đã ghi nhận chi phí từ năm phát sinh thì nay chỉ còn bút toán thanh toán, không ghi nhận chi phí lần nữa. Trường hợp trước đây chưa ghi nhận, cần xem xét ghi vào chi phí của kỳ phát hiện và đối chiếu lại với hồ sơ quyết toán thuế thu nhập doanh nghiệp của năm tương ứng.

Một số tình huống hay gặp đầu năm 2026